人理续存保障机构·迦勒底把优先让人类史延续下去作为至尊理念,为了观测仅靠魔术无法看见,仅靠科学无法测量的世界,预防会导致人类决定性灭绝的事件而日夜研究个不停。然而某天,迦勒底持续观测的未来领域消失了,根据计算,发现——不,是证明了人类将于2017年灭绝。在这过程中,历史上数个不同的位置突然出现了「无法观测的领域」。迦勒底将这些假定为人类灭绝的原因,发布了将调查、究明,或是破坏特异点为目的的"圣杯探索"任务——也就是冠位指定(Grand Order)。身负任务的立香与玛修的目的地,是确认出现在1273年的特异点。本应刚遭十字军夺回的"圣地"所在之地发生了异变。特异点正在逐渐成为「不能出现的历史」。由卡美洛降临此地的"狮子王"与"圆桌骑士",以及来自古埃及的"太阳王"奥斯曼狄斯掌握着霸权。他们是否能修复这被两股势力玩弄的时代,阻止人类的灭亡呢——